V souvislosti s modernizací trati České Budějovice - Horní Dvořiště dochází i k modernizaci staničních zabezpečovacích zařízení ve všech stanicích (viz Příprava na elektrizaci trati České Budějovice - Horní Dvořiště). Z této modernizace je prozatím vyjmuta odbočka Rožnov, kde zůstane v provozu stávající zabezpečovací zařízení. V budoucnu se však předpokládá začlenění této odbočky do uvažovaného nového staničního zabezpečovacího zařízení (typu ESA11 AŽD) žst. České Budějovice.